Enzymer

Idag har jag börjat på kapitel 8 som handlar om Enzymer. Jag tänkte därför att jag kan skriva ner lite av mina anteckningar om dessa proteiner.     Enzymernas uppgift är att katalysera biokemiska reaktioner och biologiska system. Utan enzymer skulle vår kropp inte kunna fungera då de flesta reaktioner kräver ett enzym för att reaktionen över huvudtaget ska ske. Vissa reaktioner skulle ske men de skulle ta väldigt lång tid på sig. När reaktionen väl skulle ske kanske den inte längre var nödvändig. Enzymet är en bra katalysator då det krävs en liten mängs enzym för att reaktionen ska ske och för att enzymet är väldigt specifikt. Ett enzym sätter ofta bara igång en typ av reaktion. Enzymet binder till substratet (det ämne som ska katalyseras) på en specifik plats som kallas aktivt säte (active site). Det aktiva sätet kan bara binda en molekyl som ser ut på ett specifikt sätt därför passar enzymet bara med ett visst substrat. Hur det aktiva sätet ska se ut bestäms av 5-8 aminosyror som från olika ställen på aminokedjan formas till en ”klyfta” som passar den specifika molekylen perfekt.     Den katalytiska aktiviteten hos många enzymer beror på förekomsten av små molekyler som kallas cofaktorer (cofactor). Ett enzym utan cofaktor kallas apoenzym och det kompletta, katalytiskt aktiva enzymet kallas för ett holoenzym. En cofaktor kan vara antingen en metall eller små organiska molekyler som kallas coenzymer. Coenzymerna kan binda löst eller tight till enymet. När coenzymet binds tight kallas det ”prostetic groups”. När coenzymet binder löst är det mer som ett cosubstrat eftersom det binder till enzymet och sedan släpps från det.   Eftersom de flesta enzymer är proteiner är de beroende av vilken temperatur och vilket pH man har i lösningen. På grund av denaturering går enzymets aktivitet ner mycket kraftigt vid höga temperaturer. Efter som det påverkas så av temperatur och pH är det viktigt vid laborationer och tester eller liknande att man skriver ner information om detta för att försöken eller testet ska kunna köras om av någon annan. Enzymerna brukar klassificeras efter 6 stora grupper. Oxido-reduktaser – oxidation-reduktions reaktioner. Transferaser – överföring av funktionella grupper. Hydrolaser – hydrolysreaktioner. Lyaser – delar dubbelbindningar. Isomeraser – ändring på strukturer. Ligaser – bildning av bindning med ATP-hydrolys.